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PaperIn Index ist das Werkzeug, welches mittels lexikalischer Wortlisten Verlinkungen herstellt, die der arpaBrowser benötigt, um komplexe Suchergebnisse darzustellen.
Der Indexaufbau ist sehr schnell. 100.000 Seiten werden in weniger als 30 Minuten verarbeitet. Korrekturen und Änderungen am Text sind dadurch in kürzester Zeit möglich.